A．可遗传的变异是生物进化的原因，基因突变只是其中的一种．A错误；B．变异是不定向的，变异个体中只有少数个体能适应环境而适者生存，B错误；C．生物进化的标志就是种群基因频率的改变，C正确；D．现代生物进化理论认为种群是生物进化的基本单位，而达尔文研究的水平的个体不是种群，D错误．故选：C．
