漫画里已经说的很清楚了，这是一个阴谋……是因为宇智波一族想要反叛木叶自立门户，结果呢却被三代目大大发现了，于是就给了鼬这个绝密任务，等到佐助杀了鼬才发现的，斑对佐助说的，漫画好像在四百零二左右……我忘了……
4代叫他杀的.......所以佐助知道真相后就开始对付木叶...........（4代叫鼬杀全族，才导致后来的结果..........佐助直接把这笔帐记在了木叶的头上）
我听说的版本：据木叶调查宇智波一族想要反叛木叶自立门户，而宇智波鼬是宇智波一族安插的间谍，但又被木叶收服成为宇智波一族的间谍，后三代目就给了鼬这个绝密任务为了木叶能继续存在而杀宇智波全族。又因宇智波一族是为了力量而杀死朋友残害兄弟的一族，他认为这样的一族不该存在所以要杀全族。又是为了佐助的成长。（我知道的就这么多了........）
为了木叶能继续存在 这是鼬对佐助的爱。
木叶的人命令他说的，说白了就是怕他们家的的人造反
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