阿笠博士的真实身份？

黑衣人的真正的首脑，就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。LEE。
事情是这样的，工藤优作原先就 怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一 ，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和 新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的 同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以 柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本 ，所以你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的，而成功后哀的父母意外身亡。阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没 有其他的副作用。但是突然有一天，优作和有纪子突然潜回日本，和柯南（103-104集）秘密接触，让他感受到了威胁，于是安排 一个间谍时刻跟随在柯南的身边，那就是灰原哀。哀其实是APTX-4689的第一个实验品，本来药的目的是永葆青春，没想到竟然 适得其反产生副作用，造成了身体变小。而柯南事件发生后，哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。为什么柯南从来没有被骚扰过就是因 为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下。毛利小五郎也是因为追查阿笠才从警界退出的，当时枪击非英里事件只是借口，所以 后来暮木说毛利总是把他们引向歧途。
青山刚昌已经给大家提示了，不过因为太晦涩所以没几个人看得出来。其实阿笠这两个字，如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写就是拉丁 文里面的莫里亚帝。所以阿笠博士其实应该叫莫里亚帝教授——福尔摩斯里的罪恶的教授。

我要说的是，以上是网络上流传很广的一种说法，
而我的意见是：那是扯淡！
原因应该有以下几点：1.这个说法种漏洞百出比如说“你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。”别忘了优作在贝克街的亡魂中仍有登场，阿笠还帮他一起工作，明显和以上观点矛盾。还有很多的漏洞仔细琢磨一下就会发现。
2.如果说从名字的角度来说如果牵强的直接用名字的正反写来把人划分也太不正常了吧，如果说真是这样，那只能说不是青山有病（花了这么长的时间描绘一个伏笔）就是我们这些漫画迷们智商太低。。。。。。
所以我认为阿笠应该是个华生式的人物，请不要破坏人家的形象了。。

最后祝福新一，祝福柯南，祝福哀，祝福小兰，顺便祝福秀一和无数在关注柯南的推理迷们......

你去看345集吧，那集琴酒说贝尔摩德是BOSS最喜欢的女人，但那集贝尔却差点死掉，这件事的策划者正是阿笠。另外说下，APTX-4689是致使人死亡的药物，只不过柯南有天生抗体才变成了缩小药。
至于阿笠日文反过来拼写是福尔摩斯里的罪恶的教授（莫里亚帝）的原因，告诉你，青山原本只打算让漫画出60集！！！！！后来，因柯南漫画进入白热化的阶段，所以只能保证剧情为优先，让柯南这部漫画发展下去！
BOSS，可能是FBI里的詹姆斯·布莱克，在FBI组织中，对柯南的称呼是——Cool Kid。然而在258话中，詹姆斯在心里称赞柯南时：了不起呀——Cool Guy（他知道柯南是工藤新一）！这个不该用在小男孩身上的称谓，又被Vermouth写在了飞镖靶上柯南的照片上。
另外灰原注意到的是Black（黑组织的代号），而柯南在意的则是James，他的名字和莫里亚帝教授同名而且生于伦敦，同时又来自曾经黑帮横行的芝加哥，而姓氏恰恰是英语的单词"黑"（全名James Black 詹姆士.布莱克）也就是说，他有90%的几率是————————詹姆斯·莫里亚帝教授！！！！！！！！

阿笠博士是可爱的小老头
不要相信说他是黑暗组织的头头的说法
那是谣传，不可信

阿笠博士就是一个科学家。他肯定不是什么黑衣组织首脑，青山又不傻，如果这么容易就被大家猜出来谁是boss，那柯南还有什么意思？

小道消息是黑衣组织BOSS，但个人觉得不太可能，目前来看，官方表明就是可爱的博士老爷爷~