（1）细菌耐药性的形成是经过抗生素的长期自然选择，出现了抗药性较强的菌株，且逐渐增强．其实质是种群的基因频率发生了定向的改变．（2）在菌群中，由于基因突变的频率很低，所以有抗药性基因的个体占极少数．（3）现代生物进化理论认为，种群是生物进化的基本单位．故答案为：（1）定向选择，抗药基因频率（2）基因突变的频率很低（3）种群
