若发生于心脏冠状动脉则呈现冠心病的一系列症状，如胸痛，猝死。发生在脑血管则呈现脑血管病的症状如偏瘫、失语。发生在四肢的动脉引起肢体无力、苍白、行走中疼痛，严重者肢体坏死、溃烂，导致截肢。
如果血栓发生在静脉，如下肢深静脉血栓形成可引起下肢血液回流障碍，导致水肿和静脉功能不全等。心脏或血管内已形成血栓，脱落后顺血流堵塞其他重要脏器的血管而引起综合征，如心房纤颤病人常有左心房内血栓形成，血栓一旦脱落，则可顺血流堵在脑血管，引起脑组织坏死(脑栓塞)；下肢深静脉血栓脱落，可堵塞肺动脉(肺栓塞)
，引起．急性右心衰竭，严重的可导致患者死亡。可见动脉粥样硬化血栓栓塞性疾病是全身性疾病，可以累及组织和器官，尤其是重要的器官。
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