我也遇到过类似的情况，感觉跟服务器有一定关系。
但是也有可能是flashFXP设置的原因，可以在站点设置里面打开选项，更改传输模式。或许可以解决。
选项-参数设置里面的连接标签页看看使用被动模式是不是打钩了，反正改变下这个模式试试看吧。同时传送时发送保持活动命令必须选择，还有在参数常规标签页看看发送活动保持命令应该勾选的。
建议你重新现下一个ftp软件，有的时候是软件问题
如果不是的话，原因一般是
1、你的网络问题，是不是有断ping的现象
2、服务器问题，你需要和你的服务器提供商联系
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