口腔内定居的细菌，据统计有300余种，菌种之多，数量之大居全身各部位之冠。每毫升未经刺激的唾液中细菌数达1.5×108个，以下列举部分口腔中存在的微生物，它们是：表皮葡萄球菌、甲型和丙型链球菌、肺炎球菌、奈瑟菌、乳杆菌、类白喉杆菌、俊杆菌、螺旋体、白色念珠菌、放线菌、酵母菌、原虫、支原体和病毒。如果有龋病、牙周炎等口腔慢性疾病，菌量和菌种还有不同。
