会有影响，一般影响不大；现在退税会看提单，有的地方确不看提单，当然如果看提单那必须要一致的，以免影响退税；
提单件数和报关件数不一致是没有关系的。报关单是出口用`提单是到目的海关用。提单跟其它文件一致就行了，产地证、发票、装箱单等。
