食品经营许可证和食品流通许可证有什么区别？

从本质上讲没有区别。
食品流通许可证，是对食品流通许可证的发放、发放条件、发放程序以及与食品卫生许可证的衔接等问题予以明确。
但2015年10月1日食药局发布的《食品经营许可管理办法》正式实施，流通许可证已经废止了，也就是说食品经营许可证代替了流通许可证，现在做食品餐饮，需要办的只有食品经营许可证。2015年10月1日食药局发布的《食品经营许可管理办法》正式实施，食品流通许可和餐饮许可合并为食品经营许可，也就是说食品经营许可证代替食品流通许可证。市场上已经没有食品流通许可证了。
食品经营者必须坚持先证后照，未取得前置审批文件，不得办理注册登记手续。
申请食品经营许可，应当符合下列条件：
1. 具有与经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、销售、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其他污染源保持规定的距离。
2. 具有与经营的食品品种、数量相适应的经营设备或者设施，有相应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施。
3. 有专职或者兼职的食品安全管理人员和保证食品安全的规章制度。
4. 具有合理的设备布局和工艺流程，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物。
5. 法律、法规规定的其他条件。