按你的说法来看，是你上月的增值税申报表已经申报完了，那出口报表也应出来了，但你又说在退税系统中没有做收齐，我想你可能是做了零申报了。
1、你的零申报是上月的，不是指本月的。
2、本月你依然可以做单证收齐，一般来讲关单回来的日期和运输方式有关，所以回来的快和慢都可以做BH申报，如果关单回来那就做收齐申报。
3、出口退税系统中是先录入明细，再填汇总表的，而且汇总表及附表中的数字都有逻辑性，很多是基于你的明细录入中统计出来的。
4、如果你已经申报了增值税申报表，只要你的出口销售额能和你出口退税系统中明细录入的一致就没有问题。否则你就要去税务局改动增值税申报表了。
5、退税系统中会影响到报表的只有你录入的明细数据。
6、15日申报完退税后就没别的事情了，下个月就再报上述再重复一次。。呵呵。就好。。
不冲突的。
增值税申报上的是免税申报。
单证收齐后要做的是退税申报。
免税系统和退税系统经比对无误才可退税。
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