重熙十三年(1044年),辽兴宗讨伐西夏,留耶律仁先镇守边境。不久,征召耶律仁担任先契丹行宫都部署,耶律仁担上奏请求免除王子班郎君及诸宫的杂役。重熙十六年(1047年),升任北院大王,耶律仁担上奏称如今两院户口众多而且富足,请求免予由其他部门来帮助服役,辽兴宗采纳他的建议。
重熙十八年(1049年),辽兴宗再度率军讨伐西夏,耶律仁先与皇太弟耶律重元担任前锋。萧惠在河南失利,辽兴宗还想进兵再战,耶律仁先全力谏阻,辽兴宗便停止进兵。后来耶律仁先担任知北院枢密使,升任东京留守。女真人恃仗地势险要,不停地侵犯掠夺,耶律仁先请求开挖山地沟通道路以控制,边民得以安居乐业。耶律仁先因功受封吴王。 咸雍元年(1065年),耶律仁先被加官于越,改封为辽王,与耶律乙辛共同主持北院枢密事务。耶律乙辛倚恃宠幸,违法行事,耶律仁先曾阻止他,因此受到忌恨,出贬担任南京留守,改封晋王。耶律仁先存恤孤独,禁绝奸恶,宋朝闻风震慑畏服。论及他的人认为自于越耶律休哥之后,可令宋人畏服的,只有耶律仁先一人。
阻卜塔里干背叛辽国,耶律仁先担任西北路招讨使,赐给鹰纽印和尚方剑。辽道宗晓谕说:“你此去离朝廷太远,如果每次都奏明后再行事,恐怕会失去机会,你可以随机行事,先斩后奏。”耶律仁先严密设置斥候(瞭望台),扼守敌人的要塞,对于顺服的部族加以笼络安抚,各种政务都整治得有条有理。阻卜塔里干又来侵犯,耶律仁先迎击,追杀八十多里。大军接着赶到,又击败阻卜塔里干。别部把里斯、秃没等人前来援救阻卜塔里干,见他屡次挫败,不敢与辽军交战于是投降。北部边境便得以安宁。
咸雍八年(1072年),耶律仁先去世,时年六十岁,遗命让家人薄葬。