不存在哪个好的问题，只是不同的分区有自己不同的功能而已，你当做移动硬盘的话其实也没有什么区别。
http://baike.baidu.com/link?url=0ojn7QqvW3IUUTJbCijLiQD8hHpVQ7GzStx5_KA4bcs6gvkac4U8wpeRbwgHouCzacW3f0GQ30RJJiinwvxTI_
主分区，也称为主磁盘分区，用了安装系统，引导启动的，一个硬盘可以建四个主分区，
逻辑分区没有特殊用途，所以两者就是用途不同，没有好坏之分。
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