在法治国家里，提取公民指纹就是对公民的人身搜查。司法机关无权随意搜查、逮捕公民；否则就是“程序违法”，所取的所有证据都会归于无效。以美国制度来说，刑事侦查过程中，公民受宪法第4修正案的保护，禁止不合理的逮捕和搜查。即，原则上警方要抓人和搜查，就需要向司法官申请令状(在我国是由公安机关内部签发的)，是谓“有证逮捕/搜查”。但对一些现行犯或者危急情况，警察来不及向司法官申请令状的，还可适用“无证逮捕/搜查”。但，这是受到严格限制的，必须是有“合理的理由”。这衍生出警察的截停调查权，警察把他认为有嫌疑的人截停并加以盘问，有时还有限制人身自由、搜查、提取指纹等活动，这同样受到严格限制。
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