网上报名参军是不会对你就业协议产生影响的。除非入伍通知书下来，你必须去当兵，否则就违法。但我国还没有强制参军的规定，只是要求适龄青年尽公民的义务。你不愿意去的单位可以不签，然后再找别的单位签订协议，你有选择的自由和权力。签订协议后，看接收单位是否要求调档案，如果不要求调档案，就是临时合同工的性质，你的档案可以放到人才交流中心去。一年以后的转正就需要跟单位签订正式合同或者协议了。
