首先从地表下10~15cm的土壤或者枯枝烂叶、腐烂稻草中用无菌小铲、纸袋取土样，并记录取样的地理位置、pH、植被情况等。
接下来，便是将菌体溶解，一般来说用0.9的生理盐水将土样溶解（取土样平摊于一干净的纸上，从四个角和中央各取一点土，混匀，称取1g，），再过滤（可多次过滤）直至澄清 一般来讲，样品所占欲分离微生物的数量较少，可进行富集培养
取溶解液置于装有20ml肉汤培养基的250ml三角瓶中，六层纱布封口，于80℃水浴加热处理10min，以杀死样品中的微生物营养体细胞（只留下芽孢）。然后30℃，150 r/min，振荡培养24h（芽孢萌发繁殖）。取样镜检形成芽孢的情况。
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