你好，根据自考办的规定，有二级的VF证书可以直接申请免考管理系统中计算机应用这门课程的理论和实践两门科目的，所以你有二级证书可以直接申请免考，不需要在申请管理系统中计算机应用的实践。
申请管理系统中计算机应用实践主要是针对没有二级证书的学生，参加过管理系统中计算机应用理论考试并取得合格成绩的学生才可以申请的。
另外，如果考办跟你说不用申请免考的话，那么办理毕业证的时候你直接带上二级VF的证书复印件就可以了，因为计算机证书的成绩与你的身份证号是相关的，考试院可以直接在网上查到你的成绩，不需要申请免考也可以的。
综上，希望对你有用，如果满意，请采纳，谢谢。
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