你实际付的是转账支票，就按银行存款入账。这个问题不大，如有查账可以做一下说明是临时改用的转账形式支付的货款，这是没有问题的。做账时可在此发票后面附一张现金付款形式改为转账支付的说明，并加盖财务章和公章；如果可以的话让对方公司在后面加一句以转账形式收款并加盖财务章即可。以备后面有因查账说不清楚的问题。
购入货物：
借：库存商品（或原材料）
应交税费——应交增值税（进项税）（如果是小规模没有此项，并入存货中）
贷：银行存款
借：原材料/库存商品
借：应交税金--进项
代：银行存款
粘单上贴上支票头跟发票就行
支票存根做账就行了
贷银行存款
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