有深圳一年以上的居住证和户口本原件，在深圳办理港澳通行证时,是否需要公司证明或者盖公司公章之类的。

楼上几位说的都不完全正确。
首先非深户能在深圳办理的是各种类型的赴港签注，港澳通行证只是在符合条件办理签注同时一期办理的，并不能单独办理。
赴港签注有很多种，个人游签注、团队游签注、探亲签注、商务签注都可以在深圳办理。
不过一般问的都是个人游签注（即自由行）。
非深户在深圳办理个人游签注有新旧两个政策，现在都有效，各自的要求也不一样。
旧政策要求条件：16周岁以上、非广东户籍、户籍所在地属于按需申领护照地区、有深圳居住证（即一般所说的长期居住证，有效期是十年的，并且要保证申请时居住证是有效的）一年以上。
需要证件有：身份证、居住证（这两样要求原件和复印件）、户口本复印件、在职证明（或在申请表上盖章和法人签字）、蓝底照片、照片回执。
新政策要求条件：有深圳居住证（也是十年有效期的，一年有效期的临时居住证不可以的）、过去12个月的社保在深圳购买。
需要证件有：身份证、居住证、户口本（三样都需要原件和复印件）、蓝底照片、照片回执
旧政策只能申请三个月一次或一年一次的签注，而且每个季度只能申请一次。
新政策可以申请三个月一次、三个月两次、一年一次、一年两次的签注，签注次数不限，只要用完或签注过期可以马上去续签。

我的刚办理出来，有一年以上居住证还不可以，必须是单位给办里长期居住证形式的，户口本可以是原件，还需公司公章和法人或法人代表签名才可以。

不需要单位证明，直接凭身份证、居住证在深圳市办理即可。广东省内户籍的需回户籍地办理，广东省外户籍地，可以在深圳市办理。

不用吧，我之前办就没用这些啊，而且在全国哪里办流程应该都差不多吧。不过深圳户口可以不用证的啊，直接刷指纹就可以进香港的。如果你是深圳户口那你就不用办这些了。