PCR是扩增数目的。目的基因有700多，扩增产物长度只有200. 这个就是引物选择的问题了。引物决定了扩增的起始位置，如果你选择的引物正好是500以后的位置，那么扩增产物长度就只有200了。
扩增产物长度是指你两个引物对应位点之间的长度。如果这个长度是700，你的扩增产物只有200，那就是非特异性扩增产物，不是你要的目的基因。
很可能是引物特异性的问题，一方面查查引物的属性，一方面升高温度（可以提高引物特异性）试试
