要分别赔偿费用的性质，如果是违反购销合同等支付的赔偿费用，一般分别记入“管理费用”或“销售费用”等会计科目，与生产经营无关的赔偿费用，一般应记入“营业外支出”科目。
按财务制度规定，赔偿费用进“营业外科目”，但根据税法规定，在申报企业所得税时，应在申报表中将赔偿费用调增应纳税所得额，不允许税前扣除。
赔偿不需要发票。因为不是买卖关系，开收据就可以了。
因为是导致部分货物破损，所以完整的分录：
借：材料采购或在途物资
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：银行存款等
入库时：
借：库存商品等
其他应收款——物流公司
贷：材料采购或在途物资
将来收到款项时：
借：银行存款
贷：其他应收款
同时注意部分货物破损的情况。
1.收到上游生产方赔了我600元钱
借：银行存款 600
贷：其他应付款-质量理赔 600
2.确认自己担负的理赔部分
借：营业外支出 400
贷：其他应付款-质量理赔 400
3.1000元转为货款
借：其他应付款-质量理赔 1000
贷：应收账款-下游某客户 1000
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