1、按你的要求就需要用模拟输入；
2、如果只用两个通道，那么两个通道之间的相位差如果用时间衡量就是采集频率的倒数，例如10KHz，就是0.1ms，如果提供到100KHz，就是0.01ms，所以采样频率越高，相位差越小。如果要求高还是建议用同步测量的模块，也不是很贵，你可以到NI的网站上看看，有4路100K同步采集的模块。
另外，建议你选用NI的DAQ硬件，这样好上手，技术支持也好，如果选用其他公司的硬件，虽说也都能支持Labview编程环境，但是总有些不方便的地方。
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