只要协议没有违反国家法律规定，都是有效的。你们的协议涉嫌违反法律规定，因为你们没有毕业，单位不可以跟你们签订这样的协议，你们离开也不能叫做辞职。
违约金肯定要付，但是不知道你的合同里面规定工作内容了吗？？
