买单出口和代理出口有什么根本上的区别？我公司那其他工厂的货做出口应该怎么做才好一些？

这个很简单，先给你介绍一下买单出口和代理出口的区别。
所谓买单出口，其实就是没有出口权的工厂或SOHO通过买别的进出口公司的核销单, 以该公司的名义进行外贸出口。

　　买单出口所买的“单”主要是指核销单，但是卖单出口服务的公司除了提供核销单之外还需要提供与核销单抬头一致且盖有公章的报关单、报关委托书、装箱单、商业发票、外销合同、报检委托书、存仓委托书等单证。
　选择买单出口的工厂或SOHO，他们的产品一般都具备以下特点：产品的退税率低（不值得开增票拿退税）；产品的货值小（嫌走核销、退税的途径过于麻烦）

买单出口：工厂开不出17个税点的增票---无法核销退税；

　　代理出口：工厂开具17个税点的增票---核销---退税。

　　中国的外汇管制要求谁出口，谁就收回美金，谁来核销。打个比方我用A公司的核销单出口，A公司就必需收回相对应的美金才行；但是如果你采用买单出口，就不会将美金汇到提供核销单的外贸公司，这就造成了外汇混乱。如果用A公司的核销单出口，美金又汇到A公司，那就是代理出口，属于正当操作。 这就是代理出口和买单出口的区别。

从题目来看，贵公司应该是贸易公司，具备独立的出口权。你根据改工厂提供的增值税发票的情况作打算吧。另外你要注意出口货物的退税情况。

买单出口一般是指买核销单（多用于不退税及不收汇的商品）。只要你出口后不退货、不退税、不收汇就可以采用。不存在逃税问题，挺安全的，而且费用低。
代理出口一般多用于退税及收汇的商品。你要用代理公司的名义采购货物，出口后在将外汇打给代理公司。费用相对高一些。
如果不退税，就用买单出口；退税就用代理出口;选用买单出口时一定跟物流公司签订好代理合同 .

要看你出的货是什么