很简单啊，首先在基因序列中查找5f段引物，做好标记，然后再反向互补查找3r段引物位置，做好标记，统计两个标记间的字数（包括引物）就可以了啊
你说的这个PCR后片段的大小是指你插入到载体中的目的基因长度，还是整个载体的长度啊？你的问题表述的不明白。
PCR产物大小跟载体无关。是你插进去的片段的大小再加上载体多克隆位点。不用软件，根据酶切电泳结果就知道了
测序仪
