交通客运企业认定为一般纳税人简易征收，是企业的税务问题。而个人承包经营是个人取得收入，需要按承包经营项目交纳个人所得税。企业是否替个人缴纳，则是企业与经营者如何协商的事，并不能免除承包经营者个人的税务。
