2008年秋季气温（8月～10月）全新疆大部偏高，北疆偏高幅度高于南疆，南疆西部地区偏高幅度最小。初霜期、入冬期，全疆大部分地区偏晚。秋季降水量，北疆大部分地区偏少；南疆大部分地区偏多，其中南疆西部、巴州南部部分地区异常偏多。秋季出现的气象灾害主要有局地暴雨洪水及衍生的地质灾害、霜冻、大风沙尘、寒潮等。
秋季是新疆棉花裂铃吐絮及采摘的关键阶段。全疆棉花于9月下旬初全部进入裂铃普遍期。裂铃后，大部分棉区温高少雨，光照充足，气象条件对全疆棉花的裂铃吐絮以及采摘有利。但10月上旬，全疆大部棉区出现了不同程度的降水降温天气过程，绝大部棉区气温明显下降，致使北疆棉区、哈密棉区及南疆部分棉区出现不同程度的霜冻，致使北疆大部、哈密、和硕、尉犁、拜城、阿克陶、喀什、叶城等地棉花提早停止生长。中、下旬，全疆大部棉区气温回升且偏高，降水偏少，光照充足。
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