我想问一下，高二小高考时选意向，理科类和艺术兼报理科类有什么区别吗？会不会影响理科类学校的录取？

江苏的高考制度，本人不了解。
但是可以告诉你，艺术类学校的分数不高但是分学校，加分是没有的~！
动漫设计类专业，最好的有北京电影学院动画学院，之后就是各个美术学院（八大美院，可百度下都有谁）和很多211大学中的美术或者设计类学院。
一般来说，八大美院的录取都是以专业课成绩为主，你在这些美术学院的专业考试中要取得全国范围内比较靠前的名词，这样你的文化课只要通过了你报考学校的一般文化课分数线你就考取了。
但是，以清华大学美术学院为首的211重点大学中的艺术类，就是“专业课+文化课”总分作为录取标准，也就是说你无论是专业课还是文化课，分数多多益善~！给你举个例子，以清华大学美术学院为例，你报考清华大学美术学院的动漫或者是媒体设计专业，你需要参加清华大学美术学院在全国各地设置考点的专业课考试，先取得专业课的通过（有分数线，也有名次，名次越高越好，以我当年考试的感觉，你考进全国前200名，你文化课压力就稍微小点），然后你高考（无论文理还是大综合）的成绩加上你之前的专业课成绩，就是你最后的成绩，录取不录取看你总分多少了，以我的经验，你文化课成绩在你们省一本线以上，再加上我之前说的200名以内的专业课成绩，你就能考上清华大学美术学院。以此类推，全国多数的综合大学艺术类都差不多，只是有的学校范围不是全国而是几个省，或者专业课的参考成绩比重多或者少。
艺术类现在录取学生比较开放，不要顾虑文科理科的问题，文理兼招目前适用于绝大多数学校。
祝你选对方向，考取理想学校~！