我自己是电力电子的，觉得这个专业前景挺好，就业也不错，可以在电力系统、继保、电机厂、设计院等单位就业，比较偏应用。控制科学不太懂，但是电力电子技术主要研究电能变换，其中的装置（整流器、逆变器、变频器、斩波电路）等需要用到自动控制理论，而且电力电子装置最核心的就是控制电路。很多专业都会用到控制理论，对系统进行稳定性评估等等，所以控制科学就业也应该不错。
电力电子是电气工程与自动化下的一个分支方向，一般只有在研究生阶段才会分专业，我个人偏向电力电子，但是报专业之前先咨询一下你所要考的学校，看看他们哪个专业更好就业。
这主要看你的兴趣啦。控制科学与工程应该偏理论一些，而电力电子与传动除了理论之外，更加结合实际一些也就是实践性更强一些，有很多具体工程应用。前景都是很好。所以要根据自己的情况选择。
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