论文与论著主要在医学方面有明显的区别，在医学中通常“论著”指的是“议论性著作”，具有特定的概念。“论文”则是“讨论、研究某种问题的文章”，“学术论文是较为系统地和专门讨论、研究某些学问的文章”，“科学论文应该论述一些重要的实验性的、理论性的或观测性的新知识”。
论著是医学论文体裁中常见的一种表现形式，具有特定的概念。它是作者将自己的科研、临床、教学的成果、经验、体会，以严密的逻辑论证、规范形成的文字作品，是医学论文中最具典型性和代表性的文体。
论文，古典文学中意为交谈辞章或交流思想，现多指进行各个学术领域的研究和描述学术研究成果的文章。
论文一般由题名、作者、摘要、关键词、正文、参考文献和附录等部分组成。它既是探讨问题进行学术研究的一种手段，又是描述学术研究成果进行学术交流的一种工具。
论文是要作为文章在期刊上公开发表，即论文发表。著作通常是要作为图书在出版社公开出版，即著作出版。也就是说写作论文，要匹配期刊，而编写著作，要匹配出版社。
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