是从单位在社保申报的基本账户扣除的，
过去我记得是要分两批扣除，以6月为例；
6月初1-5号之间，会扣6月的医保应缴费用；
6月底25-31号之间，会扣（除医保金外）6月保险各项应缴费用；
大致过去是这样扣除的。
扩展资料：
根据 《实施办法》,国有股转持，即股权分置改革新老划断后，凡在境内证券市场首次公开发行股票并上市的含国有股的股份有限公司，除国务院另有规定的，
均须按首次公开发行时实际发行股份数量的10%,将股份有限公司部分国有股转由全国社会保障基金理事会 （以下简称社保基金理事会）持有，国有股东持股数量少于应转持股份数量的，按实际持股数量转持。
按照中央关于机构改革的决策部署，自2019年1月1日起，由税务部门统一征收各项社会保险费和先行划转的非税收入。
参考资料来源：百度百科-划转社保
根据规定，用人单位应当为员工参加五险。参保时，个人缴费部分由公司代扣代缴。公司在发放当事人工资时依据其缴费基数、社保规定的个人缴费比例扣除社保的个人缴费部分，连同公司缴费部分一并缴存即可。
从工资汇总表里扣，即发放工资时扣的。公司交的社保，包含两部分：一部分是公司承担部分，一部分是个人承担部分，个人承担部分可以在发放工资时扣回。
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