可以申请劳动仲裁，通过仲裁解决。并且，未签订劳动合同的，在入职后第二个月起至满一年，单位应当给付双倍工资。
建议聘请律师去与单位交涉。当然，如交涉不成，那就得打官司了。
这两部分收入都要退给单位，但是这两部分收入一直计入我的收入，我还为这些前提是没有违背双方的意愿，就是你当时签订合同和补充协议时没有提出异议。
找劳动检查大队进行处理。可以要求将本人档案移交劳动局档案室保管。
