1、先看下启动完成后的hadoop的master.....log日志。
2、一般的permission denied，就是ssh环节没打通，只要再将master和slave之间把“无密码ssh登陆”就可以了。
3、stop-all.sh后打印无jobtracker....之类，是由于你一开始start-all.sh之后就没启动成namenode导致的，只要把第2步的问题搞定就算正常了。
试下看吧。
看看日志信息，还有再看看配置信息，排查一下。祝你好运。http://blog.csdn.net/yueyedeai 介绍的很详细。
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