首先，看这两个公司是不是独立的两个单位，是否同时存在。
如果是两个独立的同时存在的单位，无疑就是按过户办理。
如果是一个单位，两个单位不能同时存在，并且，其中一个单位没有被工商局注销的，那就是名字变更，股权变不变无所谓，到房产局办理更名就可以了。
如果只是名字变更，股权没有变的话，到房产局办理更名就可以了，没什么费用。
如果股东发生了变化，要按当地的规定交纳契税等税费。
税率按当地规定。
（其实就和二手房一个道理，所有权人发生了变更，就要交税）。
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