首先要明确一点：你的销售发合同是和谁签订的，如果是和总公司签订的，发票开给总公司，由分公司写联系函，说明总公司的款项由它支付，由此引起的经济纠分由它承担，加盖分公司的公章。如果合同是和分公司的订立的，由分公司付款自然没问题，但发票就不能对总公司开具，税务局查了会说你对总公司是需开发票。
