可能你以前做的项目不是用eclipse做得，而是用其它开发环境开发的，所以有时候不会匹配，你把主要的源文件拷贝，新建一个项目然后拷贝到新建项目去就差不多可以了吧，你也没有写明白，所以我大概也不知道什么问题。
选择工程，点击属性，进入属性界面:
在左侧菜单树列表中选择project Facets, 在右侧的project Facets 设置界面中勾选上动态web module ，点击下面的revert按键，就完成了转换操作，其他类似转换设置都可在这里完成。
将右上角的javaSE界面切换成javaEE模式。
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