农产品质量安全监管信息化的思路就是构建一个全方位的信息化管理平台，农业行政部门可以快捷全面地了解每一种农资产品的来源于去向、每一种农产品的种植、养殖过程，各种农产品的区域分布等，实现问题农产品的全面追溯，农业知识的普及和农业信息的交流等。农业部直属省、市、县相关行政部门、农业厅（局）、海洋与渔业厅（局）、畜牧业厅（局）等均可通过该系统实现科学高效的监管，同时也提高了农产品生产经营者的自律意识，让他们养成良好的习惯，为推动我国农产品质量安全工作长期稳定起到积极的作用。
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