霉菌和放线菌菌丝的区别为：细胞核不同、间隔不同、生长速度不同。
一、细胞核不同
1、霉菌菌丝：霉菌是一种真核生物，菌丝细胞中有细胞核。
2、放线菌菌丝：放线菌是一种原核生物，菌丝细胞中没有细胞核。
二、间隔不同
1、霉菌菌丝：霉菌由于细胞分裂的结果，菌丝是有间隔的。
2、放线菌菌丝：放线菌在一般情况下从不形成有隔菌丝，只在产生孢子时才产生间隔。
三、生长速度不同
1、霉菌菌丝：霉菌菌丝菌丝生长速度较快，可在表面生长营养菌丝可生长出营养菌丝、气生菌丝和孢子菌丝。
2、放线菌菌丝：放线菌菌丝生长速度较慢，可生长出营养菌丝、气生菌丝。
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霉菌属于真菌，是一种真核生物，因此霉菌的菌丝中有细胞核。而且有一大类霉菌的菌丝是有间隔的(细胞分裂的结果)，只有很少的一些种类具有无隔菌丝。而放线菌则是一种原核生物，其细胞内没有真正的核，而且在一般情况下从不形成有隔菌丝，只在产生孢子时才产生间隔。
另外，霉菌的菌丝比放线菌菌丝要粗。
气味
霉菌有发霉的气味
放线菌是泥土的气味
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