非正常损失造成的存货损失进项税额要转出。
非正常损失：是指因管理不善造成被盗、丢失、霉烂变质的损失，以及被执法部门依法没收或者强令自行销毁的货物。
对自然灾害造成损失的认定，原《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十一条明确：条例第十条所称非正常损失，是指生产、经营过程中正常损耗外的损失，包括：（一）自然灾害损失；（二）因管理不善造成货物被盗窃、发生霉烂变质等损失：（三） 其它非正常损失。
新的《中华人民共和国增值税条例暂行条例实施细则》第二十四条规定，条例第十条第（二）项所称非正常损失，是指因管理不善造成被盗、丢失、霉烂变质的损失。
通过新旧细则对照，可以得知“自然灾害损失”已不属于“非正常损失”，应在正常损失范围内。
根据增值税暂行条例第10条和实施细则第24条规定，非正常损失造成的存货损失进项税额要转出，否则被税务部门查到，要处罚并交滞纳金。
按照会计准则规定，是必须转出的 。
但实际操作灵活掌握
最好不要
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