有合同性质的凭证视同合同征税。如果你的协议具有合同效力，就要交税。税率视合同内容而定。
占地补偿费不知道是什么。如果是做为土地使用权转让的补偿款，要按产权转移书据纳税，税率万分之五。如果不涉及土地使用权的变更，不纳税。
工程单位，1.临时占地等协议或者合同。全按财产租赁合同（不动产租赁）来交印花税（0.001）。PS：此项要具体咨询你们税务专管！！！2.如果是与征收办或其他单位签的征拆补偿合同，不在印花税列举范围内，不用交印花税。3.如果是与单位签订临时改迁或者还建再或者直接给钱补偿工程等都是建筑安装工程承包合同（0.0003）来交印花税。
举了三个例子，希望对您有帮助，祝工作顺利。
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