据我所知，上海的农村人员通过单位是可以缴纳5险的，如果你是自己缴纳，则不缴纳公积金。
具体是这样的：为贯彻实施《社会保险法》，保障外来从业人员和郊区用人单位从业人员公平参保的权利，本市对外来从业人员综合保险和郊区用人单位从业人员小城镇社会保险进行了重大改革，自 2011年7月1日起，全部转缴城镇职工社会保险。
关于镇保改革，同样分两部分人群，第一类为2011年6月不在镇保缴费状态或2011年7月1日后新入职员工，这类人群完全按本市城镇职工社会保险有关规定参保缴费。第二类为2011年6月仍在镇保缴费状态并被继续用工的员工，参加城镇职工社会保险（即养老、医疗、失业、工伤、生育），则设置三年过渡期，缴费基数按上年度全市职工月平均工资的60％确定，缴费比例单位27%、劳动者个人7%，三年逐步过渡到单位37%，劳动者个人11%。
希望能帮到你。
建议您最好咨询上海市社会保障咨询电话12333
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