最显著的区别是，Linux重视开源，所有系统可以是完全自行构建的系统，而Windows系统、UNIX系统是不开源的，有专门团队维护、升级。
UNIX更侧重于客户端-服务器类型的大型远程连网应用，比如你要用UNIX，需要通过登录远方的服务器主机才能使用；Windows侧重单机运行，由于有微软的技术支持和服务，界面统一、操作也统一，缺点是要受强制升级的影响，开发无法自主，必须借助微软提供的开发包，对于系统是否安全无法控制，这也是政府机关不选用Win8的原因之一；Linux可以完全自主，自己可实现保证没有软件后门，免费，开源，充满活力，比前两个更适合嵌入式系统(比如手机)。另外提一下，苹果手机用的ios操作系统也是类Linux架构的系统，只不过不开源。
Linux、UNIX的原代码是公开的，而WINDOWS不是。前两者主要用在服务器上。
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