因为你朋友的过失导致公司经济利益受损,在事实上的确如此。问题的焦点是3000元的保养费和其他优惠算不算给单位造成了重大损害?我个人觉得构不成重大损害,你的朋友和单位可以协商解决此事,比如要求从工资里相应地合法地扣除损失的费用(估计成本不可能到3000元)。实在不行你可以向当地劳动仲裁院申请仲裁,让仲裁员判断是否造成了严重损害。
向当地劳动仲裁委员会申请仲裁,或者向劳动监察大队投诉。