企业开出转账支票支付甲乙材料的运杂费2100元，其中运费2000元，运费中允许抵扣的增值税为140，是什么意思

运杂费中， 只有运费2000元开增值税票，税额按7%的税率计算：2000*7%=140元。
所以，取得这张增值税票后，2100-140=1960元计入购入的货物成本， 增值税进项税额可抵扣。
借：原材料等 1 960
借：应交税费——应交增值税（进项税额） 140
贷：应付账款 2 100

支付时：
借：应付账款 2 100
贷：银行存款 2 100

意思是只有2000元可以进行进项税额抵扣，也就是抵扣140元。
附注：
1.准予抵扣的货物运费金额是指在运输单位开具的货票上注明的运费、建设基金，不包括随同运费支付的装卸费、保险费等杂费。〔国家税务总局国税函发（1995）288号文件〕
2.抵扣的运费发票一定要是经税务机关认可的,有资格开具运输发票，可抵扣的运费只有运输费和铁路基金建设费两块。

首先，您单位必须是增值税一般纳税人，外购货物（固定资产除外）所支付的运输费用，准予抵扣的运费结算单据（普通发票），是指国营铁路、民用航空、公路和水上运输单位开据的货票，以及从事货物运输的非国有运输单位开具的套印全国统一发票监制章的货票。准予抵扣的货物运费金额是指在运输单位开具的货票上注明的运费、建设基金，不包括随同运费支付的装卸费、保险费等杂费。〔国家税务总局国税函发（1995）288号文件〕
准予计算进项税额扣除的货运发票种类。根据规定，增值税一般纳税人外购和销售的货物（固定资产除外）所支付的运输费用，准予抵扣的运费结算单据（普通发票），是指国营铁路、民用航空、公路和水上运输单位开具的货票，以及从事货物运输的非国有运输单位开具的套印全国统一发票监制章的货票。准予计算进项税额扣除的货运发票种类，不包括增值税一般纳税人取得的货运定额发票。准予计算进项税额扣除的货运发票，其发货人、收货人、起运地、到达地、运输方式、货物名称、货物数量、运输单价、运费金额等项目填写必须齐全，与购货发票上所列的有关项目必须相等，否则不予抵扣。〔国税发（1995）192号文件〕
准予抵扣的运费票应严格以国税函发（1995）288号、国税发（1995）192号通知规定的种类为依据，非运输单位和部门开据的货运发票以及铁路运输部门自已开据的运费收据不得作为抵扣依据。

注意:
1)可抵扣的运费发票一定要是经税务机关认可的,有资格开具运输发票.
(2)可抵扣的运费只有运输费和铁路基金建设费两块的7%.一定要注意并非开具的所有运费均可抵扣.具体的规定你可以再到当地税务机关确认.

另外:运费发票上的其他项目,如:杂费\管理费\装卸费等其他项部可以抵扣,最好在取得运费发票后到税务机关认定一下再进行抵扣,确保万无一失.

根据相关的规定，增值税一般纳税人的运费，取得运费专用发票的，可以按7％进行进项税抵扣。本例中，只能按运费，即2000×7％＝140元，抵扣，杂费是不允许抵扣的。