第二条第一款中的另一方,是指提出鉴定申请的人的配偶。第二款的另一方,是指鉴定申请人指认的孩子的亲生父亲或母亲,未必是配偶,可以是小三申请。
如果是妻子起诉丈夫要求亲子鉴定,那么另一方指的就是丈夫,也就是孩子的父亲。如果是没有结婚或者婚外关系生育子女的,另一方就是指孩子的父亲或母亲,而不是配偶。楼上解释的比较清楚。