电子显镜只要有技术，方法得当，所以细胞器都能看见，所有细胞器都是电镜观察确认过的确实存在的。而光学显微镜，放大倍数只有几百几千倍的，只能看到大而明显的：线粒体，叶绿体，液泡，以及一些原生生物的特别细胞器。 细胞核也可见，至于内质网和高尔基体，是比较大，但光镜一般看不到。
