我是学自动化专业的，毕业两年，现在在一家机械公司做技术部的资料员，可以报考二级建造师吗？

可以报考的，各个地方的二级建造师考试合格标准 不一样，但是科目都一样，不知道你要报考哪个省的呢？
合格标准
　　全国各个地区的合格分数不一样，以当地人事考试网公布的信息为主也可以关注资格考试网的二级建造师动态。 　　浙江2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为：施工管理62分；相关知识56分；建筑工程专业科目：72分； 其它专业科目62分； 　　重庆市2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为:施工管理60分：相关知识56分;专业科目：60分； 　　安徽省2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为:施工管理65分：相关知识50分;专业科目：50分-55分； 　　上海2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为:工程法规及相关知识 60分，建设工程施工管理 65分，机电：55分，市政：60分，建筑：72分； 　　内蒙古2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为:施工管理72分：相关知识60分;专业科目：72分； 　　北京2010年二级建造师考试合格标准 　　合格标准为：建设工程施工管理65分；建设工程法规及相关知识60分；专业工程管理与实务72分； 　　云南2010年二级建造师考试合格标准 　　　合格标准为：建设工程施工管理60分；建设工程法规及相关知识55分；专业工程管理与实务除 矿业工程45分外，其余均为50分；增项考一科专业工程管理与实务72分。
考试题型
考试时间分为3个半天，以纸笔作答方式进行 　　
科目名称 考试时间 题型题量 满分
建设工程法规及相关知识 2小时 单选60个，多选20个 100
建设工程施工管理 3小时 单选70个，多选25个 120
专业工程管理与实务 3小时 单选20个，多选10个，案例分析4个（其中案例题80分） 120

建造师都是建设单位和设计单位报考的，你可能不适合。

专业受限，不可以。