为什么有些房产继承协议中的无产权房公证处不公证

举个简单的例子：
你买了个东西，自己把发票弄丢了，你看看商场还理不理你。

公证处首先要审查的是：所涉及的房产是否为“被继承人（死者）生前所遗留的合法个人财产”。对于房屋的合法与否，一要看房屋本身是否合法，比如“小产权房”、违规所建之房等，房屋本身依法都不应该存在，是为房屋本身不合法；二是要看房屋的取得方式是否合法，如房屋系非法取得，则不能公证，但我想你的问题应该不在这点之上。
从公证行业的做法来看，死者生前购买的商品房、农民转为城市居民的征地拆迁安置房、“公转私”房屋、法院判决转移产权至死者名下的房屋等，虽说只有安置协议、公转私协议或法院判决文书，但公证处同样会办理公证。
你所说的情况，要么可能是房屋本身不合法以致办不到产权证；也可能是房屋虽合法，但相关的安置协议、公转私协议签出了问题，即从协议上确定不了房屋究竟属于谁， 这很常见；还有可能，该房屋本身就不属于死者，比如公房、廉租房等；再者就可能是你们所继承协议内容与法律有冲突。
欲得具体答复，还请详细说明情况。

无产权房即使用权房（公租房、租赁房），是不能继承的（产权归国家所有），继承协议是无效的，所以公证处不会予以公证。