分情况讨论，如果质粒拷贝数不高（如严谨性复制），且外源蛋白表达水平不高，不会对宿主产生严重影响，但也容易随着细胞分裂而出现“质粒丢失”。如果质粒高拷贝或者质粒装有强启动子，胞内外源蛋白的含量会很高（甚至70%），一个是外源蛋白形成包涵体，或者启动胞内蛋白质降解系统，如蛋白酶体、热休克蛋白，加速异源蛋白的降解，此时细胞内组成型蛋白（俗称持家蛋白，即生长必须蛋白）的含量显著下降，更新速率降低，表观上就是细胞生长和分裂受限制。
如果质粒上携带有与宿主细胞基因组同源的序列，易发生重组，改变宿主细胞基因组（注意是基因组），当然也有可能使宿主某个（些）基因插入失活，比如我们将质粒插入到组氨酸合成基因中，使重组宿主成为组氨酸突变体，以供阳性筛选。这是基因工程中常见的筛选策略。
完毕，祝好
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