具体原因需要你具体描述才能判断，增值税申报系统和出口退税申报系统是两个独立的系统，但是出口退税系统在对审的时候会比对增值税数据。首先你是生产型企业还是外贸型企业？实行免抵退办法还是出口退（免）税？产生差异是当期数据差异还是本年累计数据差异？具体是哪一栏次什么内容的差异？销售额有差异？还是不得免征抵扣税额的差异？不同的差异产生的原因不一样。
有两种情况:1数据输入错误.2.C类企业单证不齐入账,
如果是第二种情况就没关系,但你要资询当地税务局有些地方的税务局会要求写情况说明!
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