首先要用你的序列blast,比较一下同源性,看看哪些同源性较高,下载同源性高的序列可以用软件自动生成,系统进化树
下载其他同源序列,进行多序列比对,然后构建进化树。可以使用MEGA,或者Mauve等软件
在NCBI上进行blast,选择与你的基因同源性高的序列下载下来用软件做发育树(常用的软件有clustal x ,mega等)